Kljub njeni svetovni slavi in nenehni izpostavljenosti javnosti pa je bilo njeno zasebno življenje zavito v tančico skrivnosti. Njene lastne osebne odločitve so včasih presegale celo njene najbolj zapletene literarne umore. Pustile so vprašanja, na katera zgodovina še danes nima jasnih odgovorov.
Največja uganka njenega življenja se je zgodila decembra leta 1926. Pisateljica je po hudi osebni krizi in moževem priznanju, da ima ljubico, sredi noči preprosto izginila v neznano.
Njen zapuščeni avtomobil so našli ob robu nevarnega prepada. To je takoj sprožilo val paničnih ugibanj o morebitnem samomoru ali umoru. V obsežno iskalno akcijo se je vključilo več tisoč prostovoljcev, policijski psi in celo slavni pisatelj Arthur Conan Doyle, ki je poskušal primer rešiti z okultnimi metodami.
Razplet je bil bizaren. Po enajstih dneh intenzivnega iskanja so Agatho končno našli v luksuznem zdraviliškem hotelu. Tam se je prijavila pod priimkom moževe ljubice.
Pisateljica o tem nenavadnem dogodku do konca svojega življenja ni želela spregovoriti niti besede. Dogodek je popolnoma zamolčala tudi v svoji uradni avtobiografiji.
Javnost še danes strastno špekulira o ozadju. Je šlo za pristno začasno amnezijo, popoln zlom živcev ali pa za genialno zrežirano maščevanje nezvestemu soprogu? Mož je namreč s tem čez noč postal glavni osumljenec v očeh celotne javnosti.
